Mitophagy-related genes might play a role in cutaneous melanoma aggressiveness

  • Autor
  • Andrey Henrique Gama Pinheiro
  • Co-autores
  • Giovanna C. Cavalcante
  • Resumo
  •  

    Mitochondria are organelles that provide the energy supply for most cellular activities but are also involved in tumor suppression processes and in other mechanisms of elimination of harmful substances to the cell. It is known that mitophagy – the elimination of damaged mitochondria – is an extremely important process for cellular homeostasis, and when performed inefficiently, there are several fundamental metabolic processes for tissue integrity that change, such as: the removal of oncogenic protein substrates, unfolded toxic proteins and damaged organelles. Therefore, mitophagy is closely related to the process of carcinogenesis. In this context, the aim of this study was to identify the mutation profile of genes involved in the mitophagy process in melanoma samples and compare mutation rate in Metastatic Melanoma (MM) and Cutaneous Melanoma (CM). Twenty-one genes involved in mitophagy were selected from mitoXplorer database (www.mitoxplorer.ibdm.univ-mrs.fr) and the information of mutation present in these genes were extracted from the following datasets available at cBioPortal (www.cbioportal.org): Metastatic Melanoma (DFCI, Science 2015), Skin Cutaneous Melanoma (TCGA, PanCancer Atlas) and Skin Cutaneous Melanoma (TCGA, Firehose Legacy). We identified mutations in 15 of the 21 genes reported to participate in the mitophagy process: AMBRA1, ATG9B, CALCOCO2, CITED2, GABARAP, NBR1, OPTN, PINK1, RRAS2, TAX1BP1, TBC1D15, TBK1, ULK1, USP15 and USP8. In the cellular interaction network, these genes have 77.90% physical interactions, 16.29% are co-expressed and the others are less significant interactions. The most common types of mutations found were missense, silent and nonsense mutations. In an individual analysis, the genes with the highest mutation rate were: AMBRA1, involved in autophagy in the control of protein turnover and the regulation of normal cell survival and proliferation; ULK1, which act indirectly in the formation of autophagophores, the precursors of autophagosomes, an important structure in the process of mitophagy; USP15 and USP8, which play critical roles in ubiquitin-dependent processes; and NBR1, a specific autophagy receptor for selective autophagic degradation. In comparison to MM, CM, which is considered the most lethal form of melanoma, did not show a significant difference in mutation rates. However, by analyzing the missense mutations, we observed that CM had a higher mutation rate in which the replaced amino acids had different physicochemical characteristics than those encoded with the mutation. The presence of mutations with significant importance may cause a cascade of malfunctions in important metabolic pathways in the cell, therefore, the accumulation of mutations in the individual favors the development of more aggressive forms of melanoma, such as CM. Given the importance of the roles of these genes, the malfunction of the pathways in which they are involved may cause the deregulation of cellular homeostasis. In addition, as observed, CM has a different mutational profile when compared to the other type of melanoma analyzed here, possibly reinforcing its lethality potential.

     

  • Palavras-chave
  • Mitophagy, Metastatic Melanoma, Cutaneous Melanoma, Cancer
  • Área Temática
  • Pós-graduação
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The Graduate Program in Genetics and Molecular Biology (PPGBM), in partnership with the Graduate Program in Oncology and Medical Sciences (PPGOCM), both from the Federal University of Pará (UFPA), will hold the 3rd International Meeting on Oncology Research on November 28 to 30, 2022 in Belém-PA.

The event's main objective is the exchange and consolidation of knowledge in cancer research, providing new perspectives and a broad forum for impactful discussions regarding the development of new diagnostic methodologies, medical segment and treatment applying precision medicine in what is most recent in this field of study. There will be discussions on topics such as: Cancer epidemiology; Molecular diagnosis; Cancer Genomics and Epigenomics; Systems Biology; New therapies in cancer; Clinical epigenetics; Precision Medicine; Bioinformatics in Cancer Research; among other topics.

The target audience of this event is mainly composed of undergraduate students who participate in the areas of Health, Biological and Exact Sciences (biology, biomedicine, medicine, pharmacy, computer science, computer engineering, etc.), university professors, researchers, professionals in the field and the general population.

The event will feature lectures, round tables and minicourses with nationally and internationally recognized names in the area. There will also be space for the presentation of abstracts in poster format and discussion of works.

This third edition of the event will take place at the Benedito Nunes Events Center, located on the campus of the Federal University of Pará (UFPA) in the city of Belém - PA, from November 28th to 30th, 2022.

____________

O Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular (PPGBM), em parceria com a Pós-Graduação em Oncologia e Ciências Médicas (PPGOCM) ambos da Universidade Federal do Pará (UFPA), realizará o 3rd International Meeting on Oncology Research nos dias 28 a 30 de novembro de 2022 em Belém-PA.

O evento tem como objetivo principal a troca e consolidação de conhecimento na pesquisa oncológica, proporcionando novas perspectivas e um fórum amplo para discussões impactantes no que diz respeito ao desenvolvimento de novas metodologias de diagnóstico, segmento médico e tratamento aplicando a medicina de precisão no que há de mais recente neste campo de estudo. Serão abordados tópicos como: Epidemiologia do câncer; Diagnóstico molecular; Genômica e Epigenômica do Câncer; Biologia de sistemas; Novas terapias no câncer; Epigenética clínica; Medicina de Precisão; Bioinformática na pesquisa em câncer; dentre outros temas.

O público-alvo deste evento é composto principalmente por estudantes de graduação que participam das áreas das Ciências da Saúde, Biológicas e Exatas (biologia, biomedicina, medicina, farmácia, ciência da computação, engenharia da computação, etc.), professores universitários, pesquisadores, profissionais da área e a população em geral.

O evento contará com palestras, mesas-redondas e minicursos com nomes reconhecidos nacionalmente e internacionalmente na área. Também haverá espaço para apresentação de resumos em formato de pôster e discussão de trabalhos.

Esta terceira edição do evento ocorrerá no Centro de Eventos Benedito Nunes, localizado no campus da Universidade Federal do Pará (UFPA) na cidade de Belém – PA, no período de 28 a 30 de novembro de 2022.

 

  • Graduação
  • Pós-graduação

Comissão Organizadora

Ândrea Kely Campos Ribeiro dos Santos – Professora Titular na Universidade Federal do Pará (UFPA). 

Paulo Pimentel Assumpção – Professor Titular na Universidade Federal do Pará (UFPA). 

Giovanna Chaves Cavalcante – Professora visitante vinculada ao Programa de pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular (PPGBM/UFPA).

Giordano Bruno Souza – Professor visitante vinculado ao PPGBM/UFPA e com atuação no Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM/UFPA).

Gilderlânio Santana Araújo – Pesquisador em bioinformática vinculado ao Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM/UFPA).

Leandro Lopes de Magalhães – Pesquisador na Universidade Federal do Pará vinculado ao Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM/UFPA).

Eric Patrick Baia da Silva – Engenheiro da UFPA, vinculado ao Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM/UFPA).

Caio Silva – Biólogo da UFPA, vinculado ao Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM/UFPA).

 

Comissão Científica

Ândrea Kely Campos Ribeiro dos Santos – Professora Titular na Universidade Federal do Pará - BRA.

Paulo Pimentel Assumpção – Professor Titular na Universidade Federal do Pará - BRA.

Rui Manuel Reis - Porfessor na Universidade do Minho - POR.

Gregory Riggins - Pesquisador na Johns Hopkins University - EUA.

Alessandro Leal - Pesquisador vinculado ao Delf Diagnostics - EUA.

Tatiana Vinasco Sandoval - Pesquisadora vinculada ao Commissariat à l’énergie atomique - FRA.

Laércio Lourenço - Médico Cirurgião no Hospital Lusíadas - POR

Giordano Bruno Souza – Professor visitante na Universidade Federal do Pará - BRA.

Giovanna Chaves Cavalcante – Professora visitante na Universidade Federal do Pará - BRA.

Leandro Lopes de Magalhães – Pesquisador na Universidade Federal do Pará - BRA.

Geraldo Ishak - Professor Adjunto na Universidade Federal do Pará - BRA.

Sandro de Souza - Professor Titular na Universidade Federal do Rio Grande do Norte - BRA.

Lacy Cardoso de Brito Júnior - Professora Associado na Universidade Federal do Pará  - BRA.

Mauro C. Cafundó de Morais - Professor na Universidade Federal de São Paulo - BRA.

Patricia Ashton-Prolla - Professora Associada na Universidade Federal do Rio Grande do Sul - BRA.

André Khayat - Professor Associado  na Universidade Federal do Pará - BRA.

Carlos Fraga - Professor Adjunto na Universidade Federal de Alagoas - BRA.

Rodrigo Dalmolin - Professor Adjunto na Universidade Federal do Rio Grande do Norte - BRA.

Sidney Emanuel Batista dos Santos - Professor Titular na Universidade Federal do Pará - BRA.

Rommel Mario Rodríguez Burbano - Professor Titular na Universidade Federal do Pará - BRA.

Samir Mansour Moraes Casseb - Professor Visitante na Universidade Federal do Pará - BRA.

Lívia Marques - Professora Visitante na Universidade Federal do Pará - BRA.

Elizabeth Chen - Professora na Universidade Federal de São Paulo - BRA.

Rafaella Sousa Ferraz - Doutoranda vinculada à Universidade Federal do Pará - BRA.

Williams Fernandes Barra -  Doutorando vinculada à Universidade Federal do Pará - BRA.

Marcus Ramos - Professor na Universidade de São Paulo - BRA.

Wilson Costa Júnior - Médico Cirurgião no Hospital A C Camargo - BRA.
 

 

 

 

 

 

 

Coordenadora Principal: Ândrea Kely Campos Ribeiro dos Santos

Email: akelyufpa@gmail.com

Comissão Organizadora

Ândrea Kely Campos Ribeiro dos Santos – Professora Titular na Universidade Federal do Pará (UFPA). 

Paulo Pimentel Assumpção – Professor Titular na Universidade Federal do Pará (UFPA). 

Giovanna Chaves Cavalcante – Professora visitante vinculada ao Programa de pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular (PPGBM/UFPA).

Giordano Bruno Souza – Professor visitante vinculado ao PPGBM/UFPA e com atuação no Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM/UFPA).

Gilderlânio Santana Araújo – Pesquisador em bioinformática vinculado ao Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM/UFPA).

Leandro Lopes de Magalhães – Pesquisador na Universidade Federal do Pará vinculado ao Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM/UFPA).

Eric Patrick Baia da Silva – Engenheiro da UFPA, vinculado ao Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM/UFPA).

Caio Silva – Biólogo da UFPA, vinculado ao Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM/UFPA).

 

Comissão Científica

Ândrea Kely Campos Ribeiro dos Santos – Professora Titular na Universidade Federal do Pará - BRA.

Paulo Pimentel Assumpção – Professor Titular na Universidade Federal do Pará - BRA.

Rui Manuel Reis - Porfessor na Universidade do Minho - POR.

Gregory Riggins - Pesquisador na Johns Hopkins University - EUA.

Alessandro Leal - Pesquisador vinculado ao Delf Diagnostics - EUA.

Tatiana Vinasco Sandoval - Pesquisadora vinculada ao Commissariat à l’énergie atomique - FRA.

Laércio Lourenço - Médico Cirurgião no Hospital Lusíadas - POR

Giordano Bruno Souza – Professor visitante na Universidade Federal do Pará - BRA.

Giovanna Chaves Cavalcante – Professora visitante na Universidade Federal do Pará - BRA.

Leandro Lopes de Magalhães – Pesquisador na Universidade Federal do Pará - BRA.

Geraldo Ishak - Professor Adjunto na Universidade Federal do Pará - BRA.

Sandro de Souza - Professor Titular na Universidade Federal do Rio Grande do Norte - BRA.

Lacy Cardoso de Brito Júnior - Professora Associado na Universidade Federal do Pará  - BRA.

Mauro C. Cafundó de Morais - Professor na Universidade Federal de São Paulo - BRA.

Patricia Ashton-Prolla - Professora Associada na Universidade Federal do Rio Grande do Sul - BRA.

André Khayat - Professor Associado  na Universidade Federal do Pará - BRA.

Carlos Fraga - Professor Adjunto na Universidade Federal de Alagoas - BRA.

Rodrigo Dalmolin - Professor Adjunto na Universidade Federal do Rio Grande do Norte - BRA.

Sidney Emanuel Batista dos Santos - Professor Titular na Universidade Federal do Pará - BRA.

Rommel Mario Rodríguez Burbano - Professor Titular na Universidade Federal do Pará - BRA.

Samir Mansour Moraes Casseb - Professor Visitante na Universidade Federal do Pará - BRA.

Lívia Marques - Professora Visitante na Universidade Federal do Pará - BRA.

Elizabeth Chen - Professora na Universidade Federal de São Paulo - BRA.

Rafaella Sousa Ferraz - Doutoranda vinculada à Universidade Federal do Pará - BRA.

Williams Fernandes Barra -  Doutorando vinculada à Universidade Federal do Pará - BRA.

Marcus Ramos - Professor na Universidade de São Paulo - BRA.

Wilson Costa Júnior - Médico Cirurgião no Hospital A C Camargo - BRA.