Associações de Candidatus Methanoplasma no microbioma intestinal de suínos com eQTLs: a ecologia microbiana como estratégia para redução do metano

Associações de Candidatus Methanoplasma no microbioma intestinal de suínos com eQTLs: a ecologia microbiana como estratégia para redução do metano

• Author
• Camila Sabino de Oliveira
• Co-authors
• Andrezza Maria Felício Ament , Bárbara Silva-Vignato , Simara Larissa Fanalli , Izally Carvalho Gervásio , Thiago Sugizaki dos Santos , Heidge Fukumasu , Luiz Fernando Brito , Aline Silva Mello Cesar
• Abstract

• A pecuária representa uma fonte crítica da emissão de metano, potente gás de efeito estufa, cuja biogênese é majoritariamente orquestrada por arqueias, componentes essenciais da microbiota intestinal. Nesse contexto, o gênero Candidatus Methanoplasma emerge como um alvo promissor para o desenvolvimento de estratégias de mitigação. Este estudo teve como objetivo investigar fatores genéticos do hospedeiro associados à prevalência de Ca. Methanoplasma em suínos, integrando dados genômicos, transcriptômicos e microbianos. Foram avaliados 72 machos imunocastrados (raça Large White), alimentados com dietas contendo óleo de soja, peixe ou canola. Os genótipos foram obtidos com o chip comercial 50K, o transcriptoma cerebral foi obtido por RNA-seq (TPM) e a microbiota cecal e fecal foi caracterizada por sequenciamento 16S rRNA (região V3–V4, pipeline DADA2, ASV ?10% de prevalência). O controle de qualidade incluiu filtragem por taxa de chamada, equilíbrio de Hardy–Weinberg, qualidade de leitura e acurácia taxonômica. A abundância de Ca. Methanoplasma foi usada como fenótipo nas análises de associação genômica ampla (GWAS) integrando eQTLs cis (?1 Mb) e trans (>1 Mb) com FDR < 5%, ajustadas para efeitos de pai e dieta. Foram identificadas três associações significativas no ceco e uma nas fezes, nos cromossomos SSC2, SSC3 e SSC8. As variantes foram associadas a nove genes, incluindo FGB, LRAT, MLN, CCNP e OR6K6, envolvidos em processos inflamatórios, metabolismo da vitamina A, integridade epitelial e regulação celular, respectivamente. Os resultados indicam que mecanismos locais e distais de regulação gênica podem influenciar a metanogênese de Ca. Methanoplasma, destacando a relevância de abordagens genético-microbianas na mitigação de metano e sustentabilidade da produção animal.

• Keywords
• metanogênese, suinocultura sustentável, interação hospedeiro-microbioma, regulação gênica, eQTLs
• Modality
• Pôster
• Subject Area
• Greenhouse gas mitigation in livestock