Análise in silico do impacto de polimorfismos de nucleotídeo único não sinônimos no gene humano da Interleucina-6 relacionado a doenças autoimunes.

Análise in silico do impacto de polimorfismos de nucleotídeo único não sinônimos no gene humano da Interleucina-6 relacionado a doenças autoimunes.

• Autor
• Arthur Felipe Ferreira de Freitas
• Co-autores
• Nara Suzy Freitas Aguiar , Martín Alejandro Montes , Maria de Mascena Diniz Maia
• Resumo

• Introdução: Polimorfismos de nucleotídeo único não sinônimos (nsSNPs) representam  uma variação genética comum que altera os aminoácidos codificados nas proteínas.  Todos os nsSNPs podem afetar potencialmente a estrutura ou função de proteínas  expressas e, portanto, podem ter um impacto em doenças. A interleucina 6 é uma citocina  pleiotrópica que atua no sistema imune e pode ser sintetizada em diversos tipos de células.  A superprodução dessa citocina resulta em complicações em várias doenças autoimunes,  como a artrite reumatoide. Justificativa: Com este estudo, torna-se possível compreender  a influência de algumas mutações missense, no gene IL6, e o seu comportamento em determinadas doenças. Objetivos: O presente estudo visa identificar e analisar mutações  missense não sinônimas de variantes do gene da IL6 para prever possíveis impactos  dessas mutações em doenças autoimunes. Materiais e métodos: Para obter os dados  sobre o gene, foram utilizados os bancos de dados Ensembl e UniProt. Para predizer os  possíveis efeitos da mutação na proteína, foram utilizados os softwares PolyPhen-2,  PROVEAN, SIFT, SNP&GO e PhD-SNP. Apenas as variantes que tiveram classificação  para “doença” no SNP&GO e PhD-SNP foram selecionadas para realizar um  levantamento bibliográfico no PubMed e Google Acadêmico. No entanto, apenas uma  variante (rs2069849) é citada em artigos científicos (39 artigos). Não foram encontradas  citações na literatura para das demais variantes. Resultados e Discussão: Após análise  dos dados, foi possível associar somente cinco nsSNPs a doenças, as variantes:  rs1282201857, rs1583431936, rs1257406129, rs756681741 e rs2069849. Na discussão  dos resultados foi possível deduzir que as substituições dos aminoácidos com composição  química e/ou tamanhos diferentes causam maior impacto na proteína. Estudos recentes  revelam que a variante rs2069849 em interação com a obesidade abdominal está  diretamente associada a um maior risco de osteoporose. Conclusão: Por meio deste  estudo, conclui-se que algoritmos computacionais podem ser uma ferramenta importante  para a classificação de variantes missense não sinônimas.  

• Palavras-chave
• IL6, nsSNPs, mutações missense, Ensembl, PolyPhen-2, PROVEAN.
• Área Temática
• Biologia (SEDE)