Expressão gênica diferencial de uma espécie de tarântula em ecorregiões da Caatinga
Fernando Sotero*, Franciane Cedrola, Vera Nisaka Solferini
Laboratório de Diversidade Genética, Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e
Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp). Rua Monteiro
Lobato, 255 - Campinas - SP - Brasil - CEP 13083-862
Introdução: A adaptação de espécies a ambientes heterogêneos com frequência envolve respostas plásticas resultantes de diferentes padrões de expressão gênica. Estudos com organismos não-modelo que ocupam diferentes regiões ainda são escassos. A Caatinga é um bioma de formações abertas exclusivo do Brasil. Ela é organizada em 9 ecorregiões, distintas em fitofisionomia, solo e regimes de chuva. A espécie de tarântula Dolichothele exilis (Araneae: Theraphosidae) ocorre em todas as ecorregiões da Caatinga. Estudos filogenéticos anteriores revelam que a variabilidade da espécie é geograficamente estruturada, com linhagens monofiléticas ocorrendo em uma ou poucas ecorregiões. O objetivo deste trabalho é investigar a expressão gênica de uma linhagem de D. exilis que ocorre em ecorregiões distintas, para contribuir com conhecimentos sobre os mecanismos de adaptações locais em organismos neotropicais. Métodos: Foram coletados organismos em 3 localidades, compreendendo 2 ecorregiões. Os palpos de cada espécime foram removidos em campo e mantidos em nitrogênio líquido até a extração do RNA e subsequente sequenciamento por RNA-Seq. A filtragem dos dados foi realizada com fastP, a verificação de qualidade com fastQC e a montagem do transcriptoma de novo com o software Trinity. Agrupamento e análises de completude foram executadas com cd-hit e BUSCO; análises de abundância e expressão diferencial utilizaram RSEM e DESeq2. Resultados: Há grande qualidade e completude dos dados. Os resultados indicam grande variação nos padrões de expressão gênica, permitindo testar hipóteses sobre as estratégias adaptativas da espécie em ecorregiões com características ambientais distintas. Discussão/conclusão: Análises com BUSCO apontam para alta completude com Arachnida e baixa com Araneae, o que indica lacunas no banco de dados de aranhas com relação a espécies de tarântulas. De um modo geral, a falta de genomas de referência para espécies não-modelo, que resulta em limitações metodológicas nas pesquisas, reforça a necessidade de mais estudos em organismos da região Neotropical, a mais biodiversa do mundo. Estudos em adaptações locais também são essenciais no entendimento das consequências dos efeitos das mudanças climáticas globais sobre comunidades ecológicas e biomas.
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Estudantes de biologia da Universidade Estadual de Campinas.
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