Introdução: Estudos de diversidade podem contribuir para o entendimento da composição e distribuição das espécies que vivem numa determinada região, bem como planos de manejo para diminuir o impacto das ações antrópicas. Os crustáceos representam um grupo ecologicamente importante nos ecossistemas marinhos costeiros, contribuindo para a produtividade e equilíbrio das teias alimentares. O tipo de substrato é um fator importante que influencia na distribuição e abundância da fauna de crustáceos bentônicos. O Complexo Baía-Estuário de Santos e São Vicente (SP) é um sistema costeiro de grande importância ecológica e econômica, mas também sujeito a intensa atividade antrópica, além disso, as espécies de importância econômica que ocorrem na área frequentemente são capturadas pela pesca de arrasto, prática que também gera significativa captura acidental (bycatch) de espécies não-alvo. Sendo assim, a finalidade do presente trabalho é analisar a composição de espécies e avaliar os índices de diversidade, equitabilidade e similaridade dos crustáceos decápodes encontrados no Complexo Baía-Estuário de Santos e São Vicente. Metodologia: As coletas foram realizadas em outubro de 2011 no Complexo Baía-Estuário de Santos e São Vicente, litoral sul de São Paulo. Quatro pontos foram amostrados no estuário (P1, P2, P3 e P4) e dois na baía (P5, P6), em áreas com profundidades de até 20m. As coletas foram realizadas com um barco camaroneiro equipado com rede de arrasto de portas com as medidas de 8 m de largura de boca, 10 m de comprimento e malhas com 15 mm de distância entrenós nas mangas e corpo da rede e 18 mm de distância entrenós no ensacador. O esforço amostral foi diferente em cada ambiente, sendo de 10 minutos no estuário e 30 minutos na baía. Os indivíduos coletados foram acondicionados em caixas térmicas e fixados em álcool 70%. Para as análises de diversidade alfa (?) dos crustáceos foram utilizados os índices de SHANNON (H’), que leva em consideração a riqueza e abundância relativa das espécies encontradas em cada ponto de amostragem e o índice de SIMPSON (D), que leva em conta as abundâncias das espécies mais comuns. A diversidade beta foi utilizada para comparar as comunidades de crustáceos decápodes entre os pontos de amostragem, sendo usada a medida de similaridade/dissimilaridade de BRAY & CURTIS cujo alcance vai de 0 (similar) até 1 (dissimilar). Todas essas análises estatísticas foram feitas com o programa R. Resultados e conclusão: Ao todo, foram registradas 12 espécies, majoritariamente de camarões, seguidos por caranguejos. O índice de diversidade de Shannon foi mais elevado no ponto P1 (H’= 1.17), com 10 espécies identificadas e distribuição equitativa entre os indivíduos. Os P5 e P6 registraram a menor diversidade com poucas espécies e dominância de Callinectes danae, mostrando maior tolerância dessa espécie a ambientes mais profundos e homogêneos. Houve uma menor similaridade (diversidade beta) entre os pontos estuarinos (especialmente P1 e P2), refletindo maior rotatividade e variação de espécies nesses locais. Já entre os pontos da baía, houve maior similaridade, compondo espécies semelhantes e dominância de poucas espécies. Os resultados demonstram um gradiente na diversidade de crustáceos entre os ambientes estuarinos e de baía. O ponto P1, com maior diversidade e sendo um ambiente de estuário possui como característica desse ecossistema maior disponibilidade de nutrientes, proteção e variedade de micro-habitats no qual observou-se um número elevado de espécies de camarões bentônicos associados a habitats estruturados e abrigados podendo indicar o uso do estuário como berçário e área de alimentação. Por outro lado, os pontos situados na baía (P5 e P6) apresentaram baixa diversidade visto que esses ambientes mais profundos, com substrato menos heterogêneo tendem a ser menos favoráveis para a instalação de espécies estuarinas. Do ponto de vista da conservação, destaca-se a importância dos estuários como habitats para várias espécies em diferentes fases do ciclo de vida. A manutenção desses ambientes, associada a medidas como a proibição da pesca durante períodos reprodutivos e a restrição de pesca de arrasto, é essencial para proteger espécies juvenis e reduzir os impactos negativos do bycatch. A espécie Xiphopenaeus kroyeri é uma espécie alvo de pesca comercial e frequentemente associada à captura acidental que podem ser descartadas com alto índice de mortalidade, afetando a sustentabilidade dos ecossistemas. A diversidade de crustáceos é fortemente influenciada pelas características ambientais dos locais amostrados. Ambientes estuarinos apresentaram maior diversidade alfa, refletindo maior heterogeneidade de habitat e função ecológica como berçário. Os resultados destacam a necessidade de medidas de conservação voltadas especialmente aos estuários, no qual a gestão adequada desses ambientes é essencial para a manutenção da biodiversidade das populações de crustáceos na região.
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