Informações

O GNPS (Global Natural Products Social Molecular Networking) é uma plataforma online e de livre acesso, voltada à análise de grandes conjuntos de dados a partir de análises de espectrometria de massas (CL-EM/EM e CG-EM) para o cálculo de redes moleculares, podendo ajudar na determinação de classes metabólicas, funções orgânicas, propriedades biológicas e quimiotaxonômicas.


EMENTA

Compreensão sobre os aspectos teóricos que fundamentam a criação das redes moleculares na plataforma Global Natural Products Social Molecular Networking-GNPS. Processamento de redes moleculares. Aprofundamento nas estratégias avançadas de anotações. Organização de resultados;

OBJETIVOS

Compreender os fundamentos teóricos envolvidos no processamento de redes moleculares e executar ferramentas básicas e avançadas destinadas ao cálculo de redes moleculares, anotações, organização e apresentação dos dados utilizando a plataforma GNPS;


Avisos:

- Para melhor aproveitamento do curso recomendamos que todos os inscritos tenham disponível um notebook para acesso à plataforma do GNPs;

- Durante a semana acertaremos os horários do curso nos dias dos jogos do Brasil:

Jogo 1 - Brasil x Sérvia. Quinta-feira: 24 de novembro, às 16h.

Jogo 2 - Brasil x Suíça. Segunda-feira: 28 de novembro, às 13h.


Mantenha medidas de proteção

Higienização das mãos; Uso de máscara; Utilização de álcool em gel;

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Palestrante

Saiba mais

Prof. Dr. Tiago Ferreira Leão

Programação:

Introdução ao conceito de Redes Moleculares - Introdução à Plataforma GNPS - Processamento de dados de MSn - Depósito de dados de MSn Curso

Processamento de redes moleculares no modo clássico molecular networking Curso

Organização e apresentação de resultados Metadata Curso

Reanálise de dados públicos - Processamento de redes moleculares no modo Feature Based Molecular Networking Curso

Bibliotecas Espectrais: contribuição, anotação e busca - Processamento de redes moleculares através de dados de CG-MS Curso

Ferramentas de anotação complementares parte I Curso

Ferramentas de anotação complementares parte II Curso

Direcionamento de Análises Curso

INPA Campus I - Sala de Apoio da antiga CPPN (Fitoquímica) -

Avenida André Araújo

Aleixo, Manaus - AM

69060-001

INPA Campus I - Sala de Apoio da antiga CPPN (Fitoquímica) -

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Avenida André Araújo

Aleixo, Manaus - AM

69060-001

Central Analítica do Laboratório Temático de Química de Produtos Naturais - CALTQPN

A CA-LTQPN é uma “facility” que congrega equipamentos analíticos modernos, disponibilizados de uma forma multiusuária, prestando serviços aos pesquisadores do instituto e das instituições de pesquisa e ensino da região nas áreas de Ressonância Magnética Nuclear e Espectrometria de Massas.

Prof. Dr. Tiago Ferreira Leão

Instituto de Química de Araraquara, Unesp


Sou originalmente do norte do Brasil, da cidade Belém do Pará, próxima ao delta do rio Amazonas e cercada pela baía de Guajará. Em 2014, recebi meu bacharelado em Biotecnologia na Universidade Federal do Pará (na minha cidade natal) e em grande parte fui bolsista de iniciação cientifica no laboratório da Profa. Paula Schneider, onde comecei a aprender genômica, filogenética e biologia molecular. Realizei um ano de meus estudos de graduação como estudante de intercâmbio na Universidade de Michigan, com apoio da Bolsa de Mobilidade Científica da Fundação CAPES (Governo do Brasil). Em Michigan, passei um verão como voluntário no laboratório do Prof. David Sherman, onde ganhei interesse pela pesquisa de produtos naturais. De volta para casa, decidi me inscrever em programas de doutorado que eu pudesse usar genômica e biologia molecular na busca de novos produtos naturais. Sendo assim, eu fiz meu Ph.D. em Biologia Marinha na Universidade da Califórnia San Diego (UCSD), mais uma vez apoiado pelo Bolsa de Mobilidade Científica da Fundação CAPES. No laboratório dos professores William e Lena Gerwick (Scripps Instituto de Oceanografia, dentro da UCSD), eu estava desenvolvendo novos pipelines e ferramentas para compreender e explorar cepas marinhas ricas em produtos naturais (por exemplo do gênero de cianobactérias chamado Moorena). Em seguida, como pós-doutorando no laboratório do professor Pieter Dorrestein (UCSD, Skaggs Departamento de Farmácia), estava tentando conectar diferentes bancos de dados à ferramenta de metabolômica chamada GNPS, especialmente no que diz respeito a algoritmos para conectar agrupamentos de genes biossintéticos (biosynthetic gene clusters ou BGCs) com seus produtos naturais correspondentes. Agora eu estou no Centro de Energia Nuclear na Agricultura (Universidade de São Paulo, USP) para dar prosseguimento a essa pesquisa de conectar genômica com metabolômica, desta vez usando cianobactérias brasileiras.

Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/8310885699711471