A LEENF é subdivida em três grandes núcleos de atuação, são eles:

O Núcleo de Enfermagem Comunitária (NEC) destina-se à elaboração e realização de atividades de extensão, voltadas às necessidades emergidas das comunidades, bem como, das Unidades Básicas de Saúde e Escolas.

O Núcleo Acadêmico de Educação em Saúde (NAES) destina-se à elaboração e realização de atividades de ensino voltadas a comunidade acadêmica, como: palestras, seminários, minicursos, entre outros.

O Núcleo Administrativo (NAD) está voltado a administração da liga, sendo responsável pelo agendamento das atividades, além de infraestrutura, patrocínio e realização de parcerias (inter)institucionais.