O Congresso Acadêmico Médico José Carlos Prates (COACME JCP) é organizado anualmente pelos acadêmicos da Faculdade de Medicina de Santo Amaro e teve sua primeira edição no ano de 1980 entre os dias 19 a 23 de maio. Atualmente, o COACME JCP já está na sua 40ª edição e é considerado o congresso acadêmico mais antigo da cidade de São Paulo.
Na 37º Edição, que ocorreu em agosto de 2016, o COACME teve a honra de ser renomeado para Congresso Acadêmico Médico José Carlos Prates (COACME JCP), em homenagem ao ilustríssimo Professor Prates, sempre presente em todas as edições.
Por sua tradição e excelência alcançadas ao longo destes anos, o COACME JCP vem obtendo sucesso em seu primordial objetivo: disseminação de conhecimento científico entre os alunos da Faculdade. Todos os anos, os congressistas têm acesso a simpósios, mesas de discussão, palestras, oficinas e workshops, sempre buscando temas atuais e inovadores na área médica, visando maior aprimoramento para graduandos e professores.
Ao longo da semana em que o Congresso ocorre, os alunos além de participarem das atividades acima relacionadas, têm a oportunidade de apresentarem trabalhos científicos nas categorias pôster e apresentação oral. As áreas são divididas por dia e os alunos são avaliados por professores convidados, sendo que os melhores trabalhos são premiados no último dia, na Solenidade de Encerramento. Além disso, os alunos inscritos podem fazer um Simulado prático e teórico das provas de Residência Médica; vantagem especial para os congressistas do 5º e 6º ano.
